Os portadores de miastenia grave possuem maior probabilidade de apresentar outra doença auto-imune. Em termos estatísticos, o lúpus, por exemplo, ocorre em cerca de 15% dos pacientes com miastenia, comparado a 3% da população em geral.
As doenças de maior incidência entre os miastênicos são a deficiência de vitamina B12, a artrite reumatóide, a doença de Graves, o lúpus, a esclerodermia.
São também exemplos de doenças auto-imunes o pênfigo, a dermatomiosite, a polimiosite, a esclerose múltipla e a anemia hemolítica, entre muitas outras. Existem mais de 80 doenças classificadas como auto-imunes. 

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