As causas da miastenia grave adquirida são desconhecidas, mas ela é claramente uma doença auto-imune na qual um ou mais anticorpos específicos foram caracterizados. Como em outras doenças auto-imunes, a doença é resultado de uma desregulação do sistema imunológico.
Uma das hipóteses para o aparecimento da miastenia adquirida é a de a pessoa ter contraído no passado uma doença provocada por vírus que levou a uma confusão no sistema imunológico.
Muitos médicos e pesquisadores concordam que o estresse pode estar relacionado com o surgimento de doenças auto-imunes. A explicação para isso é a de que o estresse interfere com a produção e a liberação de hormônios, de neurotransmissores e de outras substâncias que participam do sistema imunológico.
 
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